Die Universität ist die älteste Hochschule Lublins und zählt zu den ältesten Universitäten Polens. Sie wurde 1918 auf Initiative des Pfarrers Idzi Radziszewski gegründet, der auch der erste Rektor war. Die Hochschule fand ihren Sitz im ehemaligen Dominikaner-Oberservanten-Kloster (das zur Zeit der Annexion in Kasernen umgewandelt und stark umgebaut wurde). Die Kasernen (die sog. Heilig-Kreuz-Kasernen – in Anlehnung an den Kirchennamen) befanden sich hier bis zu Beginn der 20er Jahre des 20. Jahrhunderts, als die Gebäude der neu gegründeten Hochschule übergeben wurden, die sich bis heute hier befindet. In den 70er Jahren des 20. Jahrhunderts brannte der Vorderflügel des Gebäudekomplexes ab (der später im modernen Stil wiederaufgebaut wurde), zur Wende des 20. / 21. Jahrhundert wiederum entstand nebenan das Johannes-Paul-II.-Institut, dessen Namen die Universität heute trägt. Der spätere Papst, war über viele Jahre eng mit der Hochschule verbunden (anfangs als Dozent Pfarrer Karol Wojtyła, später als Bischof, Erzbischof und schließlich als Kardinal) und leitete den Lehrstuhl Ethik an der Philosophischen Fakultät der Katholischen Universität Lublin über fast ein Viertel Jahrhundert. Ins Auge fällt das im Innenhof stehende Denkmal, das Papst Johannes Paul II sowie den Primassen Polens Kardinal Stefan Wyszyński umarmend während der Inauguration des Pontifikats zeigt.

Im Jahr 2007 wurde das Universitätsmuseum der Katholischen Universität Lublin eröffnet, das die Geschichte und die Erfolge der Universität zeigt. An der Universität gibt es darüber hinaus viele bedeutende wissenschaftliche, gesellschaftliche und kulturelle Initiativen. Eine der bekanntesten ist die Theaterbühne von Leszek Mądzik.