Die Kirche und das Kloster wurden in den Jahren 1636-1658 für die Bernhardiner erbaut, die zu Beginn des 17. Jahrhunderts nach Lublin kamen. Beide Gebäude wurden von Piotr Czerny aus Witowice gestiftet. In der ersten Hälfte des 18. Jahrhunderts wurde ein Turm zur Kirche hinzugebaut. Das heutige Aussehen ist das Ergebnis eines Umbaus nach einem Brand im Jahr 1768.
Im Jahr 1864 erfolgte die Kassation des Bernhardinerordens. Nach der Abreise der Ordensschwestern wurden die Gebäude den Diözesepfarrern übergeben. Nach 1918 gingen die Güter wieder an den Orden, jedoch traten die Bernhardiner sie (im Jahr 1920) an die Jesuiten ab.
Das Innere der Kirche ist mit illusionistischen Neobarock-Polychromien bedeckt, die von dem Lubliner Maler Władysław Barwicki (1897) geschaffen wurden. Im Hauptalter befindet sich ein Gemälde des Malers Antoni Michalak aus der Mitte des 20. Jahrhunderts, das den Heiligen Peter zweifelnd zeigt. Der Kircheneingang befindet sich heute auf der ul. Królewska, gleich neben dem Denkmal des Pfarrers Jerzy Popiełuszko.